MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011882	CAAG	2	8	2100	2107	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011882	TCA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011882	TA	3	6	2160	2165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011882	AGG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011882	TCAT	2	8	2665	2672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011882	ACCGC	2	10	2711	2720	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011882	ATTA	2	8	5785	5792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011882	CAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011882	ATT	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011882	TTA	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011882	A	6	6	5955	5960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011882	AAT	2	6	5997	6002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011882	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011882	GT	3	6	6173	6178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011882	T	6	6	6185	6190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011882	ATT	2	6	6224	6229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011882	TAT	2	6	6230	6235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011882	ACC	2	6	7284	7289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011882	AAT	2	6	7313	7318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011882	T	7	7	8306	8312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011882	CTT	2	6	8369	8374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011882	AGT	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011882	TAT	2	6	9460	9465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011882	TGA	2	6	9483	9488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011882	TGC	2	6	9742	9747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011882	TTCAAA	2	12	9763	9774	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011882	TCC	2	6	9789	9794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_011882	GCA	2	6	12464	12469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011882	CGA	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011882	T	6	6	12549	12554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011882	TAA	2	6	12574	12579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011882	TA	4	8	13405	13412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011882	TCT	2	6	13432	13437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011882	GCT	2	6	13451	13456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011882	GAA	2	6	13487	13492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011882	CGG	2	6	13541	13546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011882	TAAT	2	8	13951	13958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011882	ATG	2	6	13959	13964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011882	TA	3	6	14007	14012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011882	GAG	2	6	14189	14194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011882	C	7	7	14229	14235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_011882	AGG	2	6	14248	14253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011882	T	7	7	14297	14303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011882	AAAT	2	8	14431	14438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011882	CAA	2	6	14481	14486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011882	AATC	2	8	17465	17472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011882	T	7	7	17514	17520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011882	TCC	2	6	17566	17571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011882	GCAATC	2	12	17585	17596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011882	ATA	2	6	17678	17683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011882	TA	3	6	17769	17774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011882	TTGTA	2	10	17821	17830	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011882	T	6	6	17838	17843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011882	T	6	6	17880	17885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011882	GAA	2	6	17976	17981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011882	CTTT	2	8	18006	18013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011882	AGT	2	6	18017	18022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011882	TTG	2	6	18027	18032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011882	AG	3	6	18918	18923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011882	TAAA	2	8	18924	18931	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011882	ATC	2	6	18984	18989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011882	TCT	2	6	19016	19021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011882	CT	3	6	19184	19189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011882	ATT	2	6	19230	19235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011882	AATT	2	8	19309	19316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011882	GAG	2	6	33004	33009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011882	CCA	2	6	34720	34725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.